بسیاری از دانش آموزان مهاجر افغان در ایالت بلوچستان پاکستان برای ادامه تحصیلات عالی با مشکلات زیادی مواجه اند. بسیاری از این جوانان به خاطر موانع راه یافتن به مکاتب و دانشگاه ها در پاکستان، از تحصیل بازمانده و ناگذیر شده اند، کار کنند. نبود یک پالیسی مشخص تحصیلی در دانشگاه ها و موسسات تحصیلی دولتی برای پناهندگان و نداشتن کارت شناسایی دراز مدت از چالش های مهم به شمار می رود.